中心基于5个虚拟仿真实验室，构建了“生物制药虚拟仿真实验教学系统”，该系统依托于上述“数字化校园建设”基础，建立了实验中心网页，制定了实验室管理的规章制度，在网页上开设了实验室仪器设备预约管理系统，可以在保障正常教学工作之余，对学校师生进行开放，从而便于学生预习和复习实验操作要点及规范性操作，方便老师和学生间实验课外的沟通与交流；建立了实验室信息化管理运行平台，实现实验教学、基本工作信息和仪器设备的计算机网络化管理。健全实验室开放运行制度和人事、经费保障机制。进一步改革与创新实验考核方法。进一步健全实验教学质量监控保障体系，提高实验教学质量。实验中心建立了实验中心专用服务器，自行开发了实验室一卡通管理系统、实验室管理系统、实验开放预约系统和系列仿真教学软件，将实验课的教学形式提升到学生个性化、自主化的学习层面。

中心购置了独立的网络服务器，建立了开放式网络化智能实验教学系统，各专业实验室构成一个有机的整体。系统集管理和辅助教学于一体，实行个性化管理，适应多层管理，具有较强的数据统计及分析功能。系统的管理功能主要由四方面组成：实验选课预约、实验教学安排、实验教学控制和实验数据管理。